针对公司注销后虚开增值税问题仍可能被发现的结论，可依据《中华人民共和国税收征收管理法》等法规进行具体分析：
根据《中华人民共和国税收征收管理法（2015年修正）》第六十三条，纳税人伪造凭证、虚假申报等偷税行为，税务机关有权追缴税款、滞纳金并处罚款，构成犯罪的追究刑事责任。公司注销仅终止主体资格，但其存续期间的虚开增值税行为属偷税范畴，税务机关对偷税行为的追征无时效限制（依据《税收征管法》第五十二条）。即便公司已注销，若虚开事实被证实，税务机关可向原股东或清算责任人追征，若涉及犯罪，公安机关仍可追究相关人员刑事责任。因此，公司注销无法免除虚开增值税行为的法律责任，问题仍可能被发现并追责。
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您问的公司注销后曾有过的虚开增值税问题是否还会被发现，这一问题的核心在于税务违法追溯的持续性。以下为您分情况详细说明：
公司注销后，虚开增值税问题仍可能被发现。
1. 若公司注销前未完成合法的税务清算或清算中未如实申报虚开行为：税务机关可通过历史发票数据、上下游企业协查等途径发现线索，启动追溯调查。
2. 若虚开行为涉及上下游企业被查处：关联案件的调查可能牵连出已注销公司的虚开事实，税务或公安部门会进一步核实。
3. 若存在知情人员举报或证据留存完整：即使公司已注销，举报线索或留存的发票、资金流水等证据仍可触发监管部门的核查。
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公司注销后面对虚开增值税问题时，需避免以下常见错误操作：
1. 销毁或隐匿历史税务资料：部分人员认为公司已注销，销毁发票、凭证可掩盖虚开事实，但此举会被认定为妨碍税务调查，反而加重处罚，甚至可能触发刑事责任（如隐匿会计凭证罪）。
2. 忽视税务机关的协查通知：若收到税务机关关于已注销公司虚开的协查要求，拒绝配合或拖延回复，会导致监管部门加大调查力度，可能通过限制个人信用、冻结资产等方式施压。
3. 盲目自行补税：未咨询专业人士的情况下，自行向税务机关补缴少量税款试图“了事”，可能因未完整覆盖虚开金额、未计算滞纳金，导致补税行为无效，仍需承担剩余责任。
若您已出现类似错误操作，或不确定如何应对潜在核查，建议尽快联系律师获取针对性指导。
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公司注销后，虚开增值税问题若被发现，可能面临以下法律风险：
1. 刑事责任风险：若虚开增值税专用发票金额较大（如超过5万元），依据《刑法》第二百零五条，可能构成虚开增值税专用发票罪。例如：某公司注销前虚开增值税发票金额达20万元，注销1年后因下游企业被查牵连出该行为，原法定代表人被公安机关立案侦查，最终被判处有期徒刑并处罚金。
2. 经济赔偿风险：税务机关可向原股东或清算责任人追征税款、滞纳金及罚款。例如：某公司注销时清算报告未披露虚开行为，税务机关发现后向原股东追缴税款10万元、滞纳金3万元，并处以5万元罚款，股东需以个人财产承担支付责任。

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